1. Cбор коллекционного материала для учебного процесса (лекций, лабораторных занятий, спецкурсов, спецсеминаров, 4 практик: полевой, специальной, производственной, предквалификационной) студентов факультетов: естествознания, адыгейской филологии и культуры, педагогического. 

2. Создание зоологического фонда.

3. Научно-исследовательская работа преподавателей, студентов и пропаганда зоологических знаний.

По первому направлению ежегодно собирается коллекционный материал в количестве около 600 экземпляров для учебных целей как демонстрационный материал, раздаточный материал для лабораторных занятий и спецкурсов. По второму направлению пересматриваются экологические биогруппы, пополняются запасники музея ежегодно на 300 музейных экспонатов по зоологии позвоночных и беспозвоночных.

По третьему направлению студенты 1-5-х курсов отделений «Биология», «География-биология», «Химия-биология» занимаются на базе музея учебно-исследовательской и научно- исследовательской работой, пишут курсовые, квалификационные работы и проходят производственную практику.

В музее проводятся экскурсии с учащимися школ Республики, студентами и специалистами. Оказывается помощь в создании биологических кабинетов (методический и коллекционный материал).

На базе зоологического музея ежегодно проводятся биологические Республиканские, олимпиады, также проводились Зональные и всероссийские биологические олимпиады (по разделу зоологии).

Сотрудники музея выполняют также научно-исследовательскую работу (опубликована 155 работа). Из них: профессором Э.А. Шебзуховой опубликовано-119 работ, доцентом Н.Д. Джимовой опубликовано – 36 работ.

Профессором Э.А. Шебзуховой написаны учебные пособия: «Позвоночные животные Адыгеи», «Редкие и исчезающие позвоночные животные Адыгеи», «Словарь – справочник «Животные Адыгеи», монография «Животный мир Адыгеи», которой присвоен гриф УМО классических университетов и педагогических институтов Министерства образования Российской Федерации.

Издана совместная работа (40-летнее исследование, посвященное животному миру Кавказа) с профессором, членом корреспондентом Российской академии наук, бывшим директором института Экологии горных территорий Кабардино-Балкарского научного центра Российской академии наук А.К. Темботовым, профессором Э.А. Шебзуховой, профессором Ф.А. Темботовой и А.А. Темботовым «Проблемы экологии горных территорий», которой присвоен гриф УМО классических университетов педагогиМинистерства образования Российской Федерации.

Учебно-методическое пособие профессора Э.А. Шебзуховой «Позвоночные животные и наблюдения за ними в Республике Адыгея», получило Гриф УМО Министерства образования и науки Республики Адыгея.

Учебно-методическое пособие профессора К.К. Хутыза, Э.А. Шебзуховой, «Охота на Западном Кавказе (с палеолита до настоящего времени)» получило Гриф УМО Министерства образования и науки Республики Адыгея.

В настоящее время проведена ревизия по систематике позвоночных животных Республики Адыгея. Профессором Э.А. Шебзуховой совместно с профессором К.К Хутызом подготовлено учебное пособие «Краткий систематический указатель позвоночных животных Кубанского варианта (Республика Адыгея)», которое находится в печати и получило Гриф УМО Министерства образования и науки Республики Адыгея.

Приводим некоторые выписки из книги отзывов о музее специалистами: доцента Т.И. Жуковой, Кубанский государственный университет: «Мне, как зоологу, понятно, какой огромный труд стоит за тем, чтобы экспонаты зоологического музея были в таком отменном состоянии, как в Майкопе. Очень много видов птиц, млекопитающих - впечатляет все сделано и поддерживается с любовью. Очень хорошо, молодцы!»; доцента З.И. Адзинба, Институт ботаники Академии наук Абхазии г. Сухум: «Восхищен богатством и отличным состоянием экспонатов этого поистине Уникального музея. Считаю, что этот музей является достоянием Республики Адыгея».