Научно-исследовательский институт комплексных проблем – основное научное структурное подразделение Адыгейского государственного университета, организованное в целях осуществления и координации исследовательской деятельности научно-исследовательских и учебно-исследовательских структур университета. В институте ведутся исследования по медико-биологическим и социально-гуманитарным наукам. Институт образован в 2009 году.

Основные направления научной деятельности института:

• биоразнообразие Кавказа;

• геоэкология, природопользование и геоинформационные системы;

• нутрициология;

• технологии мониторинга и прогнозирования состояния окружающей среды, предотвращения и ликвидации ее загрязнения;

• технологии предупреждения и ликвидации чрезвычайных ситуаций природного и техногенного характера;

• технологии живых систем и здоровьесбережение;

• технологии снижения потерь от социально значимых заболеваний;

• иммуногенетика;

• социальная психология и педагогика;

• этническая культура, этносоциальные процессы;

• социально-экономическое развитие региона.

Сегодня в институте работает 106 сотрудников, из которых 21 докторов наук и 33 кандидата наук, совместно с кафедрами ведется подготовка научных кадров.

Структура института включает центры, лаборатории, музеи, имеется редакционно-издательский отдел.

Институт поддерживает научные связи со многими научными центрами и отдельными учеными.